MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 138229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020054	CAA	2	6	164595	164600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833523
3502	NC_020054	ACA	2	6	164657	164662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833523
3503	NC_020054	TAC	2	6	164674	164679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833523
3504	NC_020054	CAG	3	9	164695	164703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3505	NC_020054	CCT	2	6	164709	164714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833523
3506	NC_020054	CAG	2	6	164737	164742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3507	NC_020054	CGGA	2	8	164803	164810	25 %	0 %	50 %	25 %	436833523
3508	NC_020054	ACA	2	6	164819	164824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833523
3509	NC_020054	GCT	2	6	164937	164942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3510	NC_020054	TCGA	2	8	164956	164963	25 %	25 %	25 %	25 %	436833523
3511	NC_020054	CAG	2	6	165001	165006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3512	NC_020054	GC	3	6	165110	165115	0 %	0 %	50 %	50 %	436833523
3513	NC_020054	GCA	2	6	165155	165160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3514	NC_020054	AGC	3	9	165218	165226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3515	NC_020054	CAG	2	6	165244	165249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3516	NC_020054	TTCAG	2	10	165284	165293	20 %	40 %	20 %	20 %	436833523
3517	NC_020054	GC	3	6	165296	165301	0 %	0 %	50 %	50 %	436833523
3518	NC_020054	GC	4	8	165315	165322	0 %	0 %	50 %	50 %	436833523
3519	NC_020054	ACG	2	6	165338	165343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3520	NC_020054	AGG	2	6	165365	165370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833523
3521	NC_020054	ACA	2	6	165374	165379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833523
3522	NC_020054	ACG	2	6	165382	165387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3523	NC_020054	TCA	2	6	165479	165484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833523
3524	NC_020054	CTG	2	6	165529	165534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833523
3525	NC_020054	ATC	2	6	165703	165708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833524
3526	NC_020054	GGCT	2	8	165725	165732	0 %	25 %	50 %	25 %	436833524
3527	NC_020054	CAA	2	6	165735	165740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833524
3528	NC_020054	AGA	2	6	165743	165748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833524
3529	NC_020054	CGA	2	6	165750	165755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833524
3530	NC_020054	AGA	2	6	165758	165763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833524
3531	NC_020054	CGT	2	6	165768	165773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833524
3532	NC_020054	GTCA	2	8	165826	165833	25 %	25 %	25 %	25 %	436833524
3533	NC_020054	CGGG	2	8	165940	165947	0 %	0 %	75 %	25 %	436833524
3534	NC_020054	GAA	2	6	166023	166028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833524
3535	NC_020054	GCT	2	6	166050	166055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833524
3536	NC_020054	CCA	2	6	166067	166072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833524
3537	NC_020054	CGGA	2	8	166350	166357	25 %	0 %	50 %	25 %	436833524
3538	NC_020054	CGC	2	6	166385	166390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833524
3539	NC_020054	CGA	2	6	166398	166403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833524
3540	NC_020054	CG	4	8	166514	166521	0 %	0 %	50 %	50 %	436833524
3541	NC_020054	GC	3	6	166579	166584	0 %	0 %	50 %	50 %	436833524
3542	NC_020054	GGT	2	6	166656	166661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833524
3543	NC_020054	A	7	7	166715	166721	100 %	0 %	0 %	0 %	436833524
3544	NC_020054	TCAT	2	8	166749	166756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_020054	TGT	2	6	166764	166769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_020054	A	6	6	166770	166775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_020054	CTT	2	6	166835	166840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_020054	GCT	2	6	166879	166884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3549	NC_020054	GAC	2	6	166888	166893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3550	NC_020054	CAG	2	6	166934	166939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3551	NC_020054	CTG	2	6	166952	166957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3552	NC_020054	TCA	2	6	166977	166982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833525
3553	NC_020054	CGA	2	6	167014	167019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3554	NC_020054	GACCTC	2	12	167086	167097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436833525
3555	NC_020054	GCA	2	6	167158	167163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3556	NC_020054	CGAC	2	8	167241	167248	25 %	0 %	25 %	50 %	436833525
3557	NC_020054	CAA	3	9	167314	167322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833525
3558	NC_020054	CAT	2	6	167368	167373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833525
3559	NC_020054	CGG	2	6	167374	167379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833525
3560	NC_020054	CCG	2	6	167487	167492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833525
3561	NC_020054	CGCC	2	8	167671	167678	0 %	0 %	25 %	75 %	436833525
3562	NC_020054	CAG	2	6	167735	167740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3563	NC_020054	GGT	2	6	167845	167850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833525
3564	NC_020054	GGT	2	6	167884	167889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833525
3565	NC_020054	TGC	2	6	167892	167897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3566	NC_020054	CGT	2	6	167946	167951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3567	NC_020054	GAT	2	6	167953	167958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833525
3568	NC_020054	TGA	2	6	168003	168008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833525
3569	NC_020054	CGG	2	6	168111	168116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833525
3570	NC_020054	GTG	2	6	168176	168181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833525
3571	NC_020054	TGA	2	6	168261	168266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833525
3572	NC_020054	CTG	2	6	168296	168301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3573	NC_020054	TCTGG	2	10	168412	168421	0 %	40 %	40 %	20 %	436833525
3574	NC_020054	CGG	2	6	168492	168497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833525
3575	NC_020054	ATC	2	6	168617	168622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833525
3576	NC_020054	CAG	2	6	168667	168672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3577	NC_020054	AACC	2	8	168877	168884	50 %	0 %	0 %	50 %	436833525
3578	NC_020054	GGC	2	6	168901	168906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833525
3579	NC_020054	CGCA	2	8	169145	169152	25 %	0 %	25 %	50 %	436833525
3580	NC_020054	GTC	2	6	169273	169278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3581	NC_020054	GTCG	2	8	169301	169308	0 %	25 %	50 %	25 %	436833525
3582	NC_020054	GAAA	2	8	169351	169358	75 %	0 %	25 %	0 %	436833525
3583	NC_020054	CAA	2	6	169400	169405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833525
3584	NC_020054	CTG	2	6	169454	169459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3585	NC_020054	TCA	2	6	169467	169472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833525
3586	NC_020054	TGG	2	6	169473	169478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833525
3587	NC_020054	TCG	2	6	169506	169511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3588	NC_020054	CTG	2	6	169547	169552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3589	NC_020054	GAT	2	6	169600	169605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833525
3590	NC_020054	TGC	2	6	169608	169613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3591	NC_020054	TGG	2	6	169620	169625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833525
3592	NC_020054	GGAA	2	8	169710	169717	50 %	0 %	50 %	0 %	436833525
3593	NC_020054	TGA	2	6	169734	169739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833525
3594	NC_020054	TCA	2	6	169824	169829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833525
3595	NC_020054	GGC	2	6	169832	169837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833525
3596	NC_020054	TCG	2	6	169844	169849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3597	NC_020054	TTG	2	6	169850	169855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833525
3598	NC_020054	GCT	2	6	169861	169866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833525
3599	NC_020054	GGT	2	6	169867	169872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833525
3600	NC_020054	CGAC	2	8	169894	169901	25 %	0 %	25 %	50 %	436833525
3601	NC_020054	GAA	2	6	169918	169923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833525
3602	NC_020054	A	6	6	169922	169927	100 %	0 %	0 %	0 %	436833525
3603	NC_020054	GCGGTT	2	12	170006	170017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3604	NC_020054	AACCGC	2	12	170036	170047	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_020054	T	6	6	170052	170057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_020054	GC	3	6	170079	170084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_020054	TGA	2	6	170117	170122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833526
3608	NC_020054	GAC	2	6	170186	170191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
3609	NC_020054	GCG	2	6	170204	170209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833526
3610	NC_020054	CCA	2	6	170300	170305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833526
3611	NC_020054	TCGGTT	2	12	170318	170329	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436833526
3612	NC_020054	CCG	2	6	170338	170343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833526
3613	NC_020054	ACCG	2	8	170370	170377	25 %	0 %	25 %	50 %	436833526
3614	NC_020054	CG	3	6	170455	170460	0 %	0 %	50 %	50 %	436833526
3615	NC_020054	ACA	2	6	170494	170499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833526
3616	NC_020054	ACG	2	6	170503	170508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
3617	NC_020054	GCC	2	6	170517	170522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833526
3618	NC_020054	GCG	2	6	170655	170660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833526
3619	NC_020054	CCG	2	6	170706	170711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833526
3620	NC_020054	ACC	2	6	170724	170729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833526
3621	NC_020054	ACAGG	2	10	170762	170771	40 %	0 %	40 %	20 %	436833526
3622	NC_020054	CTG	2	6	170778	170783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833526
3623	NC_020054	CGG	2	6	170803	170808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833526
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3659	NC_020054	A	6	6	172110	172115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3660	NC_020054	GCAA	2	8	172163	172170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3661	NC_020054	CCCCT	2	10	172174	172183	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3662	NC_020054	AGGGG	2	10	172190	172199	20 %	0 %	80 %	0 %	436833527
3663	NC_020054	TGGGG	2	10	172201	172210	0 %	20 %	80 %	0 %	436833527
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3741	NC_020054	TCG	2	6	175683	175688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833531
3742	NC_020054	CGC	2	6	175835	175840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833531
3743	NC_020054	TCG	2	6	176025	176030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833531
3744	NC_020054	TGT	2	6	176059	176064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833531
3745	NC_020054	TCG	2	6	176136	176141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833531
3746	NC_020054	GTT	2	6	176153	176158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833531
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3750	NC_020054	CGGTG	2	10	176372	176381	0 %	20 %	60 %	20 %	436833531
3751	NC_020054	GAG	2	6	176444	176449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833532
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3777	NC_020054	CAA	2	6	177651	177656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833533
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3780	NC_020054	CCAC	2	8	177731	177738	25 %	0 %	0 %	75 %	436833533
3781	NC_020054	ACGCCT	2	12	177803	177814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436833533
3782	NC_020054	GAC	2	6	177831	177836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833533
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3788	NC_020054	A	6	6	178051	178056	100 %	0 %	0 %	0 %	436833533
3789	NC_020054	TCA	2	6	178110	178115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3790	NC_020054	ATG	2	6	178151	178156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3825	NC_020054	ACCC	2	8	179873	179880	25 %	0 %	0 %	75 %	436833535
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3827	NC_020054	ACTG	2	8	179906	179913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3828	NC_020054	GTAC	2	8	179975	179982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3829	NC_020054	CGC	2	6	180006	180011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3849	NC_020054	CCG	2	6	180841	180846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3850	NC_020054	GCT	2	6	180889	180894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
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3852	NC_020054	GGGCA	2	10	180917	180926	20 %	0 %	60 %	20 %	436833536
3853	NC_020054	TCG	2	6	181029	181034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3854	NC_020054	TCGG	2	8	181074	181081	0 %	25 %	50 %	25 %	436833536
3855	NC_020054	GCA	2	6	181129	181134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3856	NC_020054	AACC	2	8	181179	181186	50 %	0 %	0 %	50 %	436833536
3857	NC_020054	TGA	2	6	181210	181215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833536
3858	NC_020054	TGT	2	6	181245	181250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833536
3859	NC_020054	GCT	2	6	181276	181281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3860	NC_020054	CGT	2	6	181309	181314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
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3862	NC_020054	AGC	2	6	181338	181343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3863	NC_020054	GTC	2	6	181379	181384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3864	NC_020054	GTTG	2	8	181401	181408	0 %	50 %	50 %	0 %	436833536
3865	NC_020054	GGA	2	6	181456	181461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833536
3866	NC_020054	ATG	2	6	181479	181484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833536
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3868	NC_020054	TA	3	6	181606	181611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3869	NC_020054	GCG	2	6	181637	181642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3870	NC_020054	ACA	2	6	181699	181704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3871	NC_020054	TGT	2	6	181747	181752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833537
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3900	NC_020054	CCGG	2	8	182772	182779	0 %	0 %	50 %	50 %	436833537
3901	NC_020054	GTT	2	6	182804	182809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833537
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3979	NC_020054	ACCC	2	8	185916	185923	25 %	0 %	0 %	75 %	436833538
3980	NC_020054	TTG	2	6	185957	185962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833538
3981	NC_020054	TTC	2	6	185971	185976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833538
3982	NC_020054	AGC	2	6	186089	186094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833538
3983	NC_020054	GCA	2	6	186101	186106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833538
3984	NC_020054	GGGCA	2	10	186148	186157	20 %	0 %	60 %	20 %	436833538
3985	NC_020054	GC	3	6	186212	186217	0 %	0 %	50 %	50 %	436833538
3986	NC_020054	CCG	2	6	186366	186371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833538
3987	NC_020054	TCA	2	6	186432	186437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833538
3988	NC_020054	CAG	2	6	186466	186471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833538
3989	NC_020054	C	9	9	186496	186504	0 %	0 %	0 %	100 %	436833538
3990	NC_020054	GGC	2	6	186505	186510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833538
3991	NC_020054	TCG	2	6	186515	186520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833538
3992	NC_020054	A	6	6	186538	186543	100 %	0 %	0 %	0 %	436833538
3993	NC_020054	CCA	2	6	186555	186560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833538
3994	NC_020054	GCG	2	6	186578	186583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833538
3995	NC_020054	CAG	2	6	186700	186705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833538
3996	NC_020054	GCA	2	6	186836	186841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833539
3997	NC_020054	ACGCG	2	10	186852	186861	20 %	0 %	40 %	40 %	436833539
3998	NC_020054	CAG	2	6	186897	186902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833539
3999	NC_020054	ACG	2	6	186937	186942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833539
4000	NC_020054	TTG	2	6	186943	186948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833539

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